Sonda Phobos-Grunt zanikla v atmosféře Země. Neřízený sestup sondy do vyšších vrstev atmosféry nastal podle předpokladů v neděli 15. ledna 2012 ve večerních hodinách a zbylé trosky dopadly do oblasti asi 1 250 km západně od ostrova Wellington při pobřeží jižní části Chile. Podle odhadů ruských odborníků mělo průlet atmosférou přežít několik desítek fragmentů o celkové hmotnosti asi 200 kg. Ostatní části z celkem více než 13 tunové sondy pak shořely v atmosféře. Zánikem sondy, která byla mimo jiné prvním ruským pokusem o meziplanetární misi po patnácti letech, došlo ke škodě zhruba 5 miliard rublů, což je v přepočtu asi 3 miliardy korun.
Problémy související se ztrátou ovladatelnosti a komunikačním spojením sondy, které nastalo po vypuštění, jsou prošetřovány a v době psaní tohoto článku nebylo ze strany ruských sdělovacích orgánů podáno prozatím žádné jasné vysvětlení.